インフォマティクス 【コード付】化合物の類似度評価方法について
この記事では化合物の類似度評価方法について解説しています。具体的には「化合物の類似度」、「Tanimoto係数」、「Dice係数」、「コサイン類似度」、「ユークリッド距離」についてまとめています。
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化学 研究開発職に必要だと思う資質
この記事は研究開発職に必要な資質についてまとめた記事になります。具体的には「分析思考」、「好奇心」、「計画性」、「発想力」、「未来志向」について解説しています。
化学 化学メーカーの研究開発職で働いて大変だったこと
この記事では化学メーカーの研究開発職で働く中で大変だったことについてまとめた記事になっています。具体的には「研究開発職とは」、「大変だったこと」、「テーマ外雑務」、「人間関係」、「法律関連」、「特許関連」について解説しています。
化学 化学メーカーで働く魅力、身に付くスキルなど解説
この記事では化学メーカーで働く魅力、身に付くスキルについて解説しています。具体的には「化学メーカーとは」、「職種について」、「メリット、デメリット」、「身についたスキル」についてまとめています。
Python GPyOptで化合物探索プログラムを実装
この記事ではGpyOptを使った化合物の探索プログラムを実装する方法について解説した記事になります。具体的にはGPyOptとは、探索の流れ、使用コード説明、探索結果について記載しています。
インフォマティクス InChIについて解説 〜化学構造をテキスト変換〜
化学構造をテキスト変換するInChIについてまとめた記事です。具体的にはInChIとは、InChIの記載方法、InChI Keyについて、InChIの取得方法について解説しています。
インフォマティクス Pythonでフィンガープリントの部分構造を可視化
Pythonにより化学構造のフィンガープリントにおける部分構造の可視化についてまとめた記事です。具体的にはフィンガープリントとは？、フィンガープリントの部分構造を可視化、複数の化合物における共通部分構造の可視化についてまとめた記事になっています。
インフォマティクス Pythonで化合物のフィンガープリントを出力
Pythonでフィンガープリントを出力する方法についてまとめました。具体的にはフィンガープリントとは何か、フィンガープリントの出力方法について解説しています。
インフォマティクス 【検証】ベイズ最適化の実装〜獲得関数による探索効率への影響〜
この記事ではベイズ最適化における獲得関数による探索効率への影響を検証した結果をまとめています。化合物のSMILESから計算した記述子を説明変数としてXlogPを目的関数とした最適化を行なっており、EI, PI, MIの獲得関数を使用しています。
インフォマティクス ベイズ最適化の実装〜カーネルによる探索効率への影響〜
ベイズ最適化におけるカーネルの探索効率への影響について調べました。実際にデータセットを使用して最適化を行ったところカーネルにより探索効率に差が確認されました。詳細については記事を参照いただければと思います。