Python 【コード付き】GpyOptでベイズ最適化を実行
この記事はGPyOptでベイズ最適化を実行する手法について解説しています。具体的にはGPyOptとは？実装コードとその解説について詳細に説明している記事となります。
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インフォマティクス InChIについて解説 〜化学構造をテキスト変換〜
化学構造をテキスト変換するInChIについてまとめた記事です。具体的にはInChIとは、InChIの記載方法、InChI Keyについて、InChIの取得方法について解説しています。
雑記 技術ブログで月間500PV達成した所感
ブログを始めて約半年経ちますが、月間500PVを達成したのでその所感についてまとめます。具体的にはこれまでの記事数とPV数、記事数とPV数の推移、収益、これまで気をつけてきたことについてまとめています。
インフォマティクス Pythonでフィンガープリントの部分構造を可視化
Pythonにより化学構造のフィンガープリントにおける部分構造の可視化についてまとめた記事です。具体的にはフィンガープリントとは？、フィンガープリントの部分構造を可視化、複数の化合物における共通部分構造の可視化についてまとめた記事になっています。
インフォマティクス Pythonで化合物のフィンガープリントを出力
Pythonでフィンガープリントを出力する方法についてまとめました。具体的にはフィンガープリントとは何か、フィンガープリントの出力方法について解説しています。
インフォマティクス クロスバリデーション（交差検証）についてわかりやすく解説
クロスバリデーションについて初心者にわかるようにまとめました。具体的にはクロスバリデーションとは何か？クロスバリデーションの種類、クロスバリデーションの実行について記載しています。
インフォマティクス ガウス過程回帰〜カーネルのハイパーパラメータ最適化〜
ガウス過程回帰などで使用されるカーネルの最適化方法についてまとめた記事です。具体的にはハイパーパラメータとは何か、ハイパーパラメータの最適化方法について解説しています。
インフォマティクス 【初心者向け】ガウス過程回帰〜カーネルについてわかりやすく説明〜
今回はガウス過程回帰などで使用されるカーネルについて解説しました。具体的にはカーネルとは何か？、カーネルの種類と特徴についてまとめた記事になります。
インフォマティクス 【検証】ベイズ最適化の実装〜獲得関数による探索効率への影響〜
この記事ではベイズ最適化における獲得関数による探索効率への影響を検証した結果をまとめています。化合物のSMILESから計算した記述子を説明変数としてXlogPを目的関数とした最適化を行なっており、EI, PI, MIの獲得関数を使用しています。
インフォマティクス ベイズ最適化の実装〜カーネルによる探索効率への影響〜
ベイズ最適化におけるカーネルの探索効率への影響について調べました。実際にデータセットを使用して最適化を行ったところカーネルにより探索効率に差が確認されました。詳細については記事を参照いただければと思います。