Python 【Pythonコード付】RDkitで化合物の構造最適化
この記事はRDkitで化合物の構造最適化を実行するPythonコードについてまとめた記事になります。具体的には「実行コード」、「化合物の3D構造生成」、「力場の作成」、「構造最適化」について解説しています。
構造式
Python 
インフォマティクス Pythonで化合物のフィンガープリントを出力
Pythonでフィンガープリントを出力する方法についてまとめました。具体的にはフィンガープリントとは何か、フィンガープリントの出力方法について解説しています。
インフォマティクス RDKit〜pythonで化学構造を描画する〜
PythonのライブラリであるRDKitを使用して化合物の構造式を描画する方法について解説しています。Jupyter notebookなど図が表示できる環境にてSMILESを読み込ませることで簡単に表示することができます。
インフォマティクス SMILES記法 〜化学構造をテキストへ変換〜
化合物の構造式をテキスト表記する方法としてSMILES表記が挙げられます。今回はこのSMILES表記について、そもそもSMILESとは？、どうやって表記するの？、取得方法は？という疑問を解決できる記事となっております。