PubChem

マテリアルズインフォマティクス(MI)

ベイズ最適化の実装〜カーネルによる探索効率への影響〜

ベイズ最適化におけるカーネルの探索効率への影響について調べました。実際にデータセットを使用して最適化を行ったところカーネルにより探索効率に差が確認されました。詳細については記事を参照いただければと思います。
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Pythonでベイズ最適化の実装

PubChemから取得したデータから説明変数をMordred記述子、目的変数をXlogPとしてベイズ最適化を実装しました。
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PubChemから化合物データを取得

PubChemから化合物データを2000件取得しました。データ取得の際に行なった処理などをご紹介いたします。
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PytyonでPubChemから化合物データを抽出してみた

PythonのライブラリであるPubchempyを使用して化合物DBであるPubChemから化合物情報を抽出してみました。抽出したデータを機械学習やデータ分析に使用することで物性や反応予測などもできるので、ぜひご覧になってください